Der Gemeinderat legt die politischen Ziele für die kommunale Arbeit fest und beschließt den Haushalt der Kommune sowie langfristige Finanzpläne u. dgl. Der Gemeinderat besteht aus 81 Mitgliedern. Die Mehrheitliche „Zusammenarbeit in Jönköping“, verfügt über 48 Mandate. Sozialdemokraten (S) und Linkspartei (V) haben zusammen 33 Mandate. Den Vorsitz hat Anna Mårtensson (FP).
Der Hauptausschuss leitet und koordiniert die übergreifenden Ziele der Kommune, die Richtlinien und steuert die kommunale Arbeit. Der Hauptausschuss hat 15 Mitglieder. Vorsitzender ist Kommunalrat Mats Green (M).
Außer Gemeinderat und Gemeindevorstand gibt es 15 Ausschüsse und 10 Teilgemeinderäte.
Rund 500 Personen sind in der Kommune Jönköping als Freizeitpolitiker engagiert. 5 von ihnen, die Kommunalräte, arbeiten ganzzeitlich als Mandatsträger.