Det är många gånger markägaren själv som tar initiativ till ett naturminne. De kontaktar då Länsstyrelsen som gör bedömning om det uppfyller kraven för naturskydd. För träd behöver det rimligtvis vara särskilt skyddsvärt enligt skyddsvärda trädinventeringsmetoden, alltså mer än 1 meter i stamdiameter eller äldre än 200 år gammalt. Inom tätorter överlämnar Länsstyrelsen vanligtvis ärendet till kommunen att ta beslut om naturskydd.

I Jönköping finns ett antal naturminnen. Alla utom ett är träd, vanligtvis ek men också bok och ask-träd.

Ekeberg är en ek och tre askar beslutade få naturminnesskydd 1909 och med översyn av beslutet 1946. En ek i Bankeryd på Solbacken blev naturskyddad 1938. I Berghem Västergård i Skärstad bildades ett naturminne för en stor ek 1960. Några askar i Taberg fick naturskydd 1965 och häckningsplats för pilgrimsfalk var sedan 1914 naturminneskyddad.

Det senast bildade naturminne i kommunen är Eken på Huskvarna kyrkogård 2019. Det är 50 år sedan sist, då en bokdunge blev skyddad vid Slottsvillan i Huskvarna 1967.